AMRcloud: как выбрать и проанализировать определенные локусы (кровь, моча, ТБД и т.д.)?

Для анализа по определенным параметрам, нужно отметить их на Шаге 2, во время загрузки файла при создании набора данных. Это тот шаг, где вы указываете столбцы с уникальными идентификаторами, видами микроорганизмов, датой и т.д. В самом низу страницы будет пункт Выберите столбцы, содержащие другие параметры для фильтрации и группировки данных.

В него можно добавить до 12 столбцов, по которым можно будет в дальнейшем фильтровать набор данных и анализировать в зависимости от различных их комбинаций. Если основываться на файле, полученным из программы WHOnet, логично бы было добавить туда столбцы DEPARTMENT и SPEC_TYPE. На экране это будет выглядеть примерно так

После того, как вы пройдете все остальные шаги, появится страница анализа набора данных и вы увидите выбранные столбцы среди фильтров.

Соответственно отмечая в параметрах определенные локусы, графики на всех вкладках будут перестраиваться.

Например, если выберем только кровь и стафилококки, то мы увидим следующую картину.

Подробнее о том, как работать с фильтрами и что можно посмотреть на различных вкладках можно посмотреть в обучающих видео на нашем youtube-канале: